Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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