Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM29Q14134 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms