Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PKP1Q13835 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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