Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms