Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA5AQ13591 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms