Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TDGQ13569 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDGQ13569 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDGQ13569 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDGQ13569 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDGQ13569 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDGQ13569 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDGQ13569 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDGQ13569 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDGQ13569 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TDGQ13569 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TDGQ13569 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms