Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms