Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PMS2P3Q13401 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms