Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CDK5R2Q13319 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms