Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms