Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT1Q02742 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 627.6 ms