Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDR2Q01850 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms