Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MDM2Q00987 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDM2Q00987 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms