Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms