Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S1P61966 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms