Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms