Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPAP53621 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPAP53621 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
COPAP53621 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms