Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETFBP38117 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms