Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZEB1P37275 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms