Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTN2P35609 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms