Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms