Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXN2P32314 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms