Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFNP31947 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFNP31947 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFNP31947 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms