Protein–RNA interactions for Protein: O95415

BRI3, Brain protein I3, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRI3O95415 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRI3O95415 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRI3O95415 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRI3O95415 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRI3O95415 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRI3O95415 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRI3O95415 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRI3O95415 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRI3O95415 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRI3O95415 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRI3O95415 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRI3O95415 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRI3O95415 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRI3O95415 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRI3O95415 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms