Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCF2LO15068 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms