Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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