Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 LINC00365-201ENST00000413591 2618 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms