Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
C9orf92A6NGG3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
C9orf92A6NGG3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
C9orf92A6NGG3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
C9orf92A6NGG3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
C9orf92A6NGG3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
C9orf92A6NGG3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms