Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms