Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAD1L1Q9Y6D9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAD1L1Q9Y6D9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms