Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFE2L3Q9Y4A8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2L3Q9Y4A8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms