Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
R3HCC1Q9Y3T6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
R3HCC1Q9Y3T6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms