Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAN1Q9Y2M0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAN1Q9Y2M0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms