Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SBNO2Q9Y2G9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SBNO2Q9Y2G9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SBNO2Q9Y2G9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SBNO2Q9Y2G9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms