Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNQ9UQP3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNNQ9UQP3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNQ9UQP3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms