Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF1Q9UMS5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF1Q9UMS5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF1Q9UMS5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms