Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT6Q9ULM6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT6Q9ULM6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms