Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBE1Q9UJT0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBE1Q9UJT0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms