Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PUF60Q9UHX1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PUF60Q9UHX1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms