Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWAP70Q9UH65 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWAP70Q9UH65 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWAP70Q9UH65 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms