Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SENP1Q9P0U3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms