Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms