Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM248Q9NWD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM248Q9NWD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.4 ms