Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLIMQ9NVW2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms