Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDX18Q9NVP1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX18Q9NVP1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms