Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVL1

FAM86C1, Protein FAM86C1, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM86C1Q9NVL1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM86C1Q9NVL1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM86C1Q9NVL1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM86C1Q9NVL1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM86C1Q9NVL1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM86C1Q9NVL1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM86C1Q9NVL1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM86C1Q9NVL1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms