Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN5Q9NRC6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN5Q9NRC6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms