Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PBXIP1-206ENST00000498553 777 ntTSL 517.41■□□□□ 0.382e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBCB-206ENST00000585910 656 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.332e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DENND6B-204ENST00000471942 990 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DENND6B-203ENST00000460087 529 ntTSL 417.06■□□□□ 0.322e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NUTF2-204ENST00000568390 593 ntTSL 316.85■□□□□ 0.292e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.272e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GCDH-209ENST00000589039 523 ntTSL 516.55■□□□□ 0.245e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DENND6B-202ENST00000433760 920 ntTSL 316.52■□□□□ 0.242e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GCDH-208ENST00000588905 562 ntTSL 516.51■□□□□ 0.235e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA8P1-204ENST00000550498 487 ntTSL 316.5■□□□□ 0.232e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 BMP7-205ENST00000460817 716 ntTSL 316.28■□□□□ 0.22e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 BMP7-203ENST00000433911 890 ntTSL 516.28■□□□□ 0.22e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NRXN2-206ENST00000417749 618 ntTSL 516.13■□□□□ 0.172e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 XYLT2-205ENST00000511654 587 ntTSL 316.08■□□□□ 0.162e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ECH1-213ENST00000601060 786 ntTSL 316.06■□□□□ 0.162e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CEP164-210ENST00000533433 1565 ntTSL 215.96■□□□□ 0.152e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-205ENST00000487120 2159 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.142e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 RPA2-205ENST00000444045 682 ntTSL 515.85■□□□□ 0.132e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 USP4-212ENST00000486549 749 ntTSL 515.83■□□□□ 0.122e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GNL3-203ENST00000460073 583 ntTSL 415.7■□□□□ 0.15e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ECH1-216ENST00000601778 799 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-210ENST00000563363 619 ntTSL 515.36■□□□□ 0.052e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-203ENST00000431934 1284 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.36■□□□□ 0.052e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CEP164-205ENST00000528706 1407 ntTSL 215.34■□□□□ 0.052e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF239-204ENST00000491188 701 ntTSL 215.22■□□□□ 0.032e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NUTF2-202ENST00000567105 582 ntTSL 315.22■□□□□ 0.032e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 02e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN25-210ENST00000493443 558 ntTSL 414.74□□□□□ -0.052e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-214ENST00000567852 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.67□□□□□ -0.062e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN25-208ENST00000481424 5722 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.062e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SWAP70-203ENST00000524817 3006 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.112e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 KDM8-213ENST00000569329 583 ntTSL 214.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NUTF2-207ENST00000570026 400 ntTSL 214.29□□□□□ -0.122e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-213ENST00000532452 451 ntTSL 314.12□□□□□ -0.158e-16■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAAL1-205ENST00000530180 657 ntTSL 514.12□□□□□ -0.155e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 KDM8-203ENST00000562269 779 ntTSL 314.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PBXIP1-205ENST00000493133 707 ntTSL 313.92□□□□□ -0.182e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN25-207ENST00000473646 584 ntTSL 413.84□□□□□ -0.192e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SAMD4A-209ENST00000555719 413 ntTSL 213.75□□□□□ -0.212e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 KDM8-204ENST00000562733 560 ntTSL 413.74□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 NUTF2-203ENST00000568233 589 ntTSL 213.74□□□□□ -0.212e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PSMD5-AS1-214ENST00000640391 707 ntTSL 213.46□□□□□ -0.255e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ECH1-202ENST00000594164 677 ntTSL 313.45□□□□□ -0.262e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSPAN18-212ENST00000533202 549 ntTSL 413.15□□□□□ -0.32e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN25-205ENST00000431485 594 ntTSL 413.15□□□□□ -0.32e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PITPNM2-203ENST00000436074 1288 ntTSL 313.08□□□□□ -0.322e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 STXBP1-205ENST00000496504 591 ntTSL 213.05□□□□□ -0.322e-44■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF239-202ENST00000374446 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 DGKD-214ENST00000495901 535 ntTSL 212.96□□□□□ -0.332e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 KDM8-201ENST00000286096 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CPT1A-203ENST00000537756 585 ntTSL 412.92□□□□□ -0.342e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 AC092279.1-201ENST00000594934 1864 ntTSL 212.91□□□□□ -0.342e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GIT1-214ENST00000585148 686 ntTSL 312.89□□□□□ -0.352e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TNFAIP1-201ENST00000226225 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.375e-30■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CUTC-203ENST00000471520 831 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.372e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CEP164-207ENST00000532187 658 ntTSL 312.64□□□□□ -0.392e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 AC092279.1-202ENST00000597683 1966 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CLCN5-203ENST00000376091 3046 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GIT1-212ENST00000581925 610 ntTSL 412.5□□□□□ -0.412e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 SNU13-207ENST00000469522 640 ntTSL 212.47□□□□□ -0.412e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 IFT122-220ENST00000509815 422 ntTSL 512.41□□□□□ -0.422e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 KDM8-207ENST00000564961 1075 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 USP4-205ENST00000431357 2141 ntTSL 512.04□□□□□ -0.482e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN25-203ENST00000394150 2823 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBCB-207ENST00000586868 466 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 POP5-204ENST00000535245 608 ntTSL 311.87□□□□□ -0.512e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TSNAXIP1-206ENST00000561639 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.522e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PRRC1-203ENST00000507774 703 ntTSL 211.46□□□□□ -0.577e-22■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 PIK3R1-216ENST00000523872 2473 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.592e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 TBX5-204ENST00000526441 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GIT1-215ENST00000586574 576 ntTSL 411.22□□□□□ -0.612e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-216ENST00000479362 700 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.632e-15■■■■■ 372.6
UTP3Q9NQZ2 GNL3-205ENST00000468146 533 ntTSL 411.09□□□□□ -0.635e-30■■■■■ 372.6
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