Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PFDN4Q9NQP4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFDN4Q9NQP4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms