Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUFT1Q9NNX1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUFT1Q9NNX1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUFT1Q9NNX1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms